तीन नैसर्गिकरित्या उद्भवणारे हायड्रोजन समस्थानिक आहेत: प्रोटियम, ड्यूटेरियम आणि ट्रिटियम , हायड्रोजनला प्रोटियम देखील म्हणतात. हायड्रोजनचा हलका समस्थानिक प्रोटियम म्हणून ओळखला जातो, परंतु त्याला $^1H$ व्यतिरिक्त कोणतेही रासायनिक चिन्ह नाही.