बुरशीचे वर्गीकरण मायसेलियमचे आकारविज्ञान, बीजाणू तयार करण्याची पद्धत आणि फळ देणाऱ्या शरीरांवर आधारित आहे. हे राज्याच्या विविध वर्गांमध्ये विभागणीसाठी आधार बनवतात.